Koelwater
De nieuwe centrale verbruikt ongeveer 33 m3 koelwater per seconde. Dit koelwater wordt, net als voor de bestaande centrale, uit de Europahaven gepompt en via een blokkendam op de Noordzee geloosd. Temperatuurmetingen van de bestaande centrale binnen de blokkendam en op de Noordzee hebben aangetoond dat de beïnvloeding door de koelwaterlozing verwaarloosbaar is. Ook wordt de bodem van de Noordzee niet opgewarmd. Een zogenoemde lagune met een blokkendam blijkt een goede methode om het warme water te lozen zonder dat het milieu wordt beïnvloed.
Tweede Maasvlakte
Als de Tweede Maasvlakte klaar is, zal de lozing naar de nieuwe Yangtzehaven worden verplaatst. Uit studies is gebleken dat door de werking van eb en vloed vermenging van het koelwater met het zeewater in de haven plaatsvindt. Ook dan zijn er nauwelijks meetbare temperatuurverschillen.